利用口腔采样做个人隐私亲子鉴定

做个人隐私亲子鉴定时，经常使用的鉴定样本是从口腔黏膜上皮细胞获取，这种方法简单便利又没有侵入性，其次是抽血化验。而由于许多个人隐私亲子鉴定机构是由专业妇产科医师执业，或是由医院妇产科负责取样，因此像是怀孕中的胎儿羊水、胎儿绒毛，或是妇女的流产胚胎等特殊检体，也能用来做化验。

除此之外，检测机构也常接获为了争夺财产，或不确定谁是孩子的父亲，而瞒着伴侣，带着沾有精液的卫生纸或保险套、残存有唾液的筷子或茶杯、毛髮等，到检测机构要求做个人隐私亲子鉴定案例。这些特殊检体只要没有受到污染，也都能用做个人隐私亲子鉴定。

基因相合程度是判断核心。倘若父子两人同一基因点位有相同的「短重复(通常由4个核苷酸为核心单位组合的DNA片段)」相符合，就算「不可排除」，如此一连13个基因点位都「不可排除」的话，经过统计学的计算，通常能得到99.99%以上的亲子关係机率，也就确认了2人的亲子关係。

而倘若13个基因点位中起码有3个以上不合，按国际医界的共识，这对案例就能判断为不具亲子关係。

不过，人的基因点位是有可能突变的，但机率约仅1/1,000，因此倘若比对的结果是只有1或2个点位不合，需要思考是不是基因突变的问题，此时就要再检测更多的基因点位，或是透过其他的辅助鉴定系统，例如：加验性染色体(X或Y染色体)上的DNA，或是细胞质中的粒腺体DNA，来加以排除或确认亲子关係。